En 1986, il obtient un doctorat d'économie à la Fletcher School, de l'université Tufts, dans la région de Boston aux États-Unis.
De 1986 à 1992, il enseigne l'économie à l'université de Kinshasa et sert respectivement comme conseiller au gouverneur de la Banque centrale du Congo et conseiller économique au Premier ministre et aux ministres de la Planification économique, de la Gestion de Budget, des Transports et de la Communication et du Commerce extérieur.
En juillet 1992, Matungulu devient économiste pour le Fonds monétaire international (FMI). En tant que représentant du FMIau Cameroun, il supervise notamment un programme de réforme économique débuté en 1996, qui aura permis plus tard au pays d'être éligible pour l'Initiative pays pauvres très endettés (PPTE).À partir d'avril 2001, il est ministre des Finances de la République démocratique du Congo. Il démissionne en février 2003, devenant ainsi le premier ministre des finances congolais à quitter son poste sans avoir été limogé.
Fin février 2015, Matungulu annonce sa retraite anticipée du FMI aux États-Unis, pour se consacrer à la politique.